聚醚类TPU内的醚基与聚酯类TPU内的酯基的极性不同，以及分子结构存在差异，而导致醚基一般在酯基树脂中的兼容性差，所以将两者混合起来就会出现分层现象，另外还与醚键的分子间作用力有较密切的关系，此外，聚酯的结晶性一般比聚醚的结晶性强很多，故其兼容性亦较差。

    但并不是所有的醚类都这样，因为PTMG（聚四氢呋喃）的结晶性和聚酯的结晶性差不多，因此用PTMG合成的聚醚类TPU与聚酯类TPU的兼容性就稍好一些，在合成过程中是可以进行合成的，只不过其加工后的各项物理性能还是会大大下降，得不偿失，故亦没有必要进行该项共混。

    由此可见，醚类与酯类是不能混合在一起进行加工的，这是由于二者的分子结构差异、分子内聚能差异、分子间作用力差异、结晶性差异及其二者分子的不兼容性所决定的当将其二者进行共混加工时在试件表面将会出现明显的纹路，会有混浊现象产生。即便是可以勉强混合在一起进行加工，加工后的成品各种物理性能也还是会大大下降，尤其是不能用于加工特别透明的配件，在大批量的生产中亦会有很大难度，在生产过程中亦要尤其注意切勿将二者误混.